2009年8月25日，台湾屏东县林边地区清理污泥的台军撤除一部份，军人们戴着口罩，快速奔跑在林边街头准备撤离。由于灾区卫生情况恶化及其他原因，台湾甲型H1N1流感疫情严峻，台湾“中研院”院士陈建仁推估，台湾恐有7千人死亡。
2009年8月19日，前往小林村寻找罹难者遗体的士兵戴著口罩列队出发。
2009年8月23日，在新开部落开挖行动中，挖出一个遗体，救灾人员以尸袋将遗体运送出去。
8月26日，防疫人员正在屏东万丹乡消毒，该乡的湾内村目前约有100余人集中发热。
2009年8月25日，台湾屏东县林边地区清理污泥的台军撤除一部份，军方将清扫用品移上军用卡车。
8月24日，台湾屏东万丹乡湾内村，台风导致的水灾冲来了许多漂流物，其中夹杂了动物尸体等。这也可能是导致甲流蔓延的原因之一。
